Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PAGR1Q9BTK6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAGR1Q9BTK6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms