Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT17Q9BSW7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT17Q9BSW7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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