Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SGIP1Q9BQI5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms