Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RETNLBQ9BQ08 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms