Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCNX1Q96RV3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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