Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ALS2CR12Q96Q35 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms