Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC7Q96NW7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC7Q96NW7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms