Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP44Q96MT7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP44Q96MT7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms