Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL15Q96M94 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms