Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNBD2Q96M20 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CNBD2Q96M20 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms