Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms