Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
UBE2E2Q96LR5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms