Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC00208Q96KT6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms