Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC41A2Q96JW4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms