Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CELF6Q96J87 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms