Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPNQ96H22 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms