Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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FAM3DQ96BQ1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FAM3DQ96BQ1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM3DQ96BQ1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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