Protein–RNA interactions for Protein: Q96A56

TP53INP1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53INP1Q96A56 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TP53INP1Q96A56 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TP53INP1Q96A56 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms