Protein–RNA interactions for Protein: Q92930

RAB8B, Ras-related protein Rab-8B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB8BQ92930 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB8BQ92930 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms