Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CSRNP3Q8WYN3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms