Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HAVCR2Q8TDQ0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms