Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRSK1Q8TDC3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRSK1Q8TDC3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
BRSK1Q8TDC3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BRSK1Q8TDC3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms