Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC21AQ8NDW8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC21AQ8NDW8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms