Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP1Q86WV1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms