Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA2D4Q7Z3S7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms