Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUP54Q7Z3B4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms