Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q71RC1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Q71RC1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Q71RC1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q71RC1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q71RC1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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