Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM43BQ6ZT52 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM43BQ6ZT52 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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