Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF613Q6PF04 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms