Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRRC8EQ6NSJ5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRRC8EQ6NSJ5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRRC8EQ6NSJ5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRRC8EQ6NSJ5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRRC8EQ6NSJ5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRRC8EQ6NSJ5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRRC8EQ6NSJ5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms