Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT80Q6KB66 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KRT80Q6KB66 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms