Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPW1

C11orf71, Uncharacterized protein C11orf71, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf71Q6IPW1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
C11orf71Q6IPW1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms