Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ETFRF1Q6IPR1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms