Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms