Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLC27A3Q5K4L6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms