Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FREM1Q5H8C1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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