Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms