Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF1Q3BBV0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms