Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HFEQ30201 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HFEQ30201 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HFEQ30201 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms