Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LETM2Q2VYF4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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