Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC57Q2TAC2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms