Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCDC142Q17RM4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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