Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHQ16836 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHQ16836 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHQ16836 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHQ16836 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHQ16836 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HADHQ16836 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HADHQ16836 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HADHQ16836 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HADHQ16836 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HADHQ16836 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HADHQ16836 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HADHQ16836 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HADHQ16836 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HADHQ16836 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HADHQ16836 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HADHQ16836 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HADHQ16836 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HADHQ16836 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HADHQ16836 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HADHQ16836 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HADHQ16836 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HADHQ16836 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HADHQ16836 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HADHQ16836 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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