Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UPP1Q16831 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms