Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CARTPTQ16568 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms