Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
USF2Q15853 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
USF2Q15853 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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