Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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PTPRRQ15256 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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PTPRRQ15256 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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PTPRRQ15256 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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PTPRRQ15256 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PTPRRQ15256 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PTPRRQ15256 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PTPRRQ15256 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRRQ15256 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
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