Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECTIN1Q15223 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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