Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERC3Q15034 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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