Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMD6Q15008 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMD6Q15008 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms